西晋和东晋都是后人用来区分这两个朝代而做的称呼，它们自己本身在历史上，都是叫“晋代”。但是由于西晋灭亡后，其后裔才在南方又建立了新的“晋”z权，为了研究和称呼的方便，以致不会引起歧义和混淆，所以用“西”和“东”做了区分。
1、军事体制不雷同
西晋的军事制度沿袭曹魏，采用世兵制。东晋虽然沿袭西晋军事制度，但已有变化。因为皇权衰微，中央军往往有名无实，共同驻在京师的还有扬州都督所属军队。外军大多由世族的军队组成，统军将领称霸一方，其中荆州军甚至超越中央军。
2、领土疆域不一样
西晋承袭曹魏领土，在统一后领有孙吴疆域。其疆域北至山西、河北及辽东，与南匈奴、鲜卑及高句丽相邻；东至沿海；南至交州（今越南北部）；西至甘肃、云南，与河西鲜卑、羌及氐相邻。是面积较大的统一疆域。
再看东晋的领土则随其疆域的变化而时有增减。由于外族入侵与晋军北伐，北疆时常变动；四川先后出现成汉、谯蜀等国；东南疆域大致固定。
后来桓温发动三次北伐，一度收复山东及河南地区，但之后败于前燕而止。前秦屡次入侵东晋领土，此时东晋仅剩扬、荆、江、广、交、豫、徐、兖、益、宁七州，及兖、青、冀、司、幽、并、益等侨州，共十五州。
3、存活时间东晋长于西晋
西晋因为晋武帝选择接班人不当，让“低能儿”司马衷当上了皇帝，并大肆实行分封制，从而发生了后来的“八王之乱”及“五胡”，这样就大大缩短了西晋王朝的寿命，所以它只存活了短暂的51年。
而东晋，虽然其政治制度等与西晋类似，但它吸取了前朝的教训，加上涌现出王导、顾荣、谢安等士族强人掌控朝政，他们注意平衡门阀贵族之间，及士族与穷苦百姓之间的关系，并始终以长江为天险，多次北伐，达到巩固南方的目的，所以才让东晋得以生存了比西晋长一倍的时间（104年）。
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