地理
在地理方面，孙吴的学者严畯曾写过《潮水论》。这是现所知最早的一篇潮汐学专著，是我国气象学与海洋学的开端。三国末期孙吴将领沈莹著述的《临海水土志》，记载了台湾原住民山夷与大陆百越民族同根同源的文化渊源关系；并从地理方位、气候和地形，以及居民的生产习俗等方面，记述了台湾岛的自然环境及高山族的社会生活发展情况。这一著作对当时的台湾人民的生活有详细的描写，是世界上记述台湾最早的文字。
《临海水土志》是世界上最早记录台湾的文献之一，三国东吴临海郡太守沈莹可以称之为最早的研究台湾的学者，在他的《临海水土志》对当时被称为“夷洲”的台湾情况有着专门记载，只是此书已经流失，主要内容记载在《太平御览》之中。从所记内容来看，这是当时最完整的关于台湾的文字资料。
天文
在天文历法方面，孙吴科学家对天体的探讨十分活跃，孙吴的天文学家王蕃以浑天论名于当世，提高了测定黄赤交角的精确性；陈卓把源自战国时代的天文学家石申、甘德、巫咸等三家学派所著星图命名的恒星，加以综合，构成一个相对完整的全天星官系统。
他以二十八宿为基础，再将石、甘、巫咸三派天文学家所定的星官，并同在一起，去重复，存不同，绘成全天星图，构建了一个全天星官系统。陈卓的全天星官系统一直沿用到近代。他的这一标准一直是后世天文学者制作星图和浑象的重要依据，并得到了充分的肯定。
数学
在数学上，汉末三国时期天文、历法的发展，也推动了数学的发展，在孙吴涌现了一批杰出的数学家，取得了数学发展史上的标志性成果。其中以赵爽的《周髀算经注》最为著名。赵爽是第一个对《周髀算经》进行认真而全面研究的学者。
他的研究分为：解释文字，推演数学理论，补图等三个方面，突出的贡献主要有两点：一是以“弦图”证明勾股定理。二是对“出入相补原理”的运用。他在“勾股圆方图”书中采用“弦图”对勾股定理进行证明，这一方法比外国同类方法早约一千年；在研究二次方程得出的结论，与“韦达方程”类似，但比韦达早了一千三百多年。孙吴学者阚泽对圆周率也很有研究，祖冲之对圆周率的精确计算就是借鉴了他的成果。
《周髀算经》原名《周髀》，算经的十书之一，是我国最古老的天文学和数学著作，约成书于公元前1世纪，主要阐明当时的盖天说和四分历法。唐初规定它为国子监明算科的教材之一，故改名《周髀算经》。
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