宁王叛乱是统治阶级内部所进行的一场皇权争夺战，它对明朝的政局产生了较大的影响。首先，叛乱给江南尤其是南昌人民带来了深重的灾难，造成了社会的混乱，也导致了明武宗统治的结束。宁王叛乱虽然仅43天就宣告失败，然而，朱宸濠在江西的聚敛刻薄及其叛乱的直接破坏，使江西人民深受其害，正如王守仁在杭州向提督军务太监张永所陈述的江西兵乱后的困敝：“江西之民，久遭濠毒，今经大乱，继以旱灾，又供京边军饷，困苦既极，必逃聚山谷为乱。”

而明武宗的南下巡游，又使这种灾难得到进一步的加深。在朱宸濠起兵之时，明武宗以亲自率兵征讨为由，开展了一场空前的南下出巡游乐活动。一路上游山玩水，捕鱼打猎。每到一个地方，文武百官需戎装步行迎送车驾，随行的幸臣江彬还不时传旨征索财物，稍不如意，则羞辱、殴打地方官吏。又派兵士四出至百姓家，矫传上旨，索取鹰犬、珍宝、古玩，甚至夜半闯入民宅抢夺妇女，造成江南一带民间汹汹不安，苦不堪言。

地方混乱

王守仁等擒获朱宸濠；也受到幸臣们的嫉妒，他们一面以搜捕宸濠余党为由，到江西大行株连诬陷，屠戮无辜，甚至连平叛有的吉安知府伍文定也被抓来捆绑；一面制造流言，污蔑王守仁“与宸濠通谋，虑事不成乃起兵”。当王守仁从南昌出发，准备将朱宸濠献给明武宗时，他们又屡屡遣人进行阻止，要求王守仁把朱宸濠释放在鄱阳湖地区，“待上自擒之”。明武宗一行的所作所为，造成了江西地方人人自危，社会极端混乱。

推进改革

此事件也促成了明朝统治者政治改革的进行。自明武宗逝世到明世宗朱厚熜即位，期间有37天是由内阁首辅杨廷和总揽朝政，面对叛乱初定及各地农民起义的严峻形势，杨廷和用颁发明武宗遗诏、皇太后懿旨和明世宗登基诏书的办法，进行了一些改革。如：停京师不急工务，裁汰锦衣卫、内监局旗校工役人数，减少漕粮，驱逐因恩幸得官者等，这些改革有一定的进步性。

及至明世宗即位后，在杨廷和改革的基础上继续进行了一系列的善政，政治方面有：逮捕武宗年间作恶多端的宦官；革传升官；尽罢“诸镇守内官”；开放言路，命群臣陈民间利病。经济方面有：罢除额外的征收，以减轻百姓的负担；对受灾地方采取修义仓、置义田、行和籴代赈等办法；清理庄田等。这些善政对革除明武宗时期的弊端，缓和各种社会矛盾产生了一定的作用。

削弱宗族

再次，彻底了结了历代宁王与皇帝间的虬结。从高祖朱权开始，历代宁王与朝廷之间的矛盾重重。燕王朱棣发起靖难之役时，为谋得大宁诸军的助战，用计挟制宁王朱权，使大宁边军俱听其指挥，朱棣还哄骗朱权：“事成，当中分天下。”燕王即皇帝位后，宁王要求改封苏州、钱塘等南方地方，均遭朱棣拒绝，宁王与皇帝间的矛盾由此而生。

朱权死后，其孙朱奠培嗣位，因“增造宫殿及派岁禄于进府县，奏请南昌城内东、西二湖”，被时任左布政使的崔恭而生怨恨，“遂劾奏（崔）恭不法，恭与按察使原杰亦奏奠培私献惠二王宫人，逼内官熊璧自裁。按问皆实，遂夺护卫”。削去宁王护卫，改为南昌左卫，使自朱权以来与朝廷间的矛盾进一步加剧。朱宸濠反叛失败后，正德十五年十二月，朱宸濠在通州被处死，并遭到了焚尸扬灰的下场，既而明废除宁王封国。经过这次剧烈的变故，宁王府这支宗族终于归于平静，彻底安于眼前的地位和处境。

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