藤野严九郎（英文：Fujino Genkuro；1874年7月11日～1945年8月11日），出生于日本福井县，毕业于爱知医学校（现名古屋大学），日本医生、教授。藤野严九郎因和其学生鲁迅的交往而闻名。其家族世代为医，藤野严九郎是藤野家的第六代医生。

藤野在读小学时，跟酒井藩校教师野坂先生学过汉学。1892年4月，从福井学校中途退学，进入爱知医学校（现名古屋大学）。1896年10月毕业，并留校作解剖学教师奈良坂的助手。1897年5月，得到医生开业证明书，同年7月开始，在东京帝国大学（现东京大学）医学院学习解剖学一年。

1901年10月，藤野应聘到仙台医科专门校（现东北大学）任解剖学讲师，其时藤野刚刚满27岁。1911年，东北帝国大学（现东北大学）成立，1912年仙台医科专门校并入，成立为东北帝国大学医学部。1915年决定成立东北帝国大学医科大学，藤野因学历不够，被迫于6月底提出“请求免职”，7月1日降为临时讲师，8月9日被解除讲师职务。1919年回故乡自立诊所。1945年8月11日（日本宣布投降的4天前）在福井逝世。

藤野先生生于1874年7月11日，9岁时父亲亡故，由大哥二哥抚养，严九郎排行老三。他在读小学时，跟酒井藩校教师野坂先生学过汉学。

1892年4月，从福井学校中途退学，进入爱知医学校（现名古屋大学）。1896年10月毕业，留校作解剖学教师奈良坂的助手。

1897年5月，得到医生开业证明书，同年7月开始，在东京帝国大学（现东京大学）医学院学习解剖学一年。

1901年10月，藤野应聘到仙台医专任解剖学讲师，其时藤野刚刚满27岁。他和敷波重次郎教授担任一年级的解剖学理论，他还担任二年级的解剖实习和局部解剖学。一年级的专业课只有解剖学，一年级的正副班主任大体上照例由敷波和藤野担任。班主任管理的范围很广，据当时仙台医专规定，诸如学生的学习态度、学生的管理教导、出席情况、考试成绩的统计以及教室的整理和保管，都由正副班主任负责。

1911年，东北帝国大学成立，1912年仙台医专并入，成为东北帝大医学部，所有校舍、教职员、学生原班未动。1915年决定成立东北帝国大学医科大学，藤野因学历不够，被迫于6月底提出“请求免职”，7月1日降为临时讲师，8月9日被解除讲师职务。藤野因生活关系，认为可以搞一搞耳鼻喉的工作，到东京三井公司的慈善医院就业。1919年回故乡自立诊所，1945年8月11日（日本宣布投降的4天前）在福井逝世。

藤野严九郎在战后被认为是对中日友好作出了贡献。

1961年在福井市建立了纪念碑。

1983年5月18日，鲁迅的故乡绍兴市和藤野的故乡芦原町（现芦原市）结成友好城市。

1984年7月，他的故居被改造成藤野严九郎纪念馆。他生前任教的日本东北大学(原名东北帝国大学)设立了“东北大学藤野先生奖”。《藤野先生》作为中日两国的语文课课文，他的名字也广为人知。

2006年，北京的鲁迅博物馆和藤野的出生地福井县芦原市分别向东北大学赠送了鲁迅和藤野的胸像。

1904年7月6日，即大约鲁迅到仙台前两个月，藤野由讲师升为教授。藤野生活朴素，当时教授上课，来回都坐人力车，而藤野则是步行，他住在空堀町，离仙台医专有步行三五分钟的距离。

鲁迅离开仙台前曾到他家去过，他送给鲁迅一张照片，背面写上：“惜别藤野谨呈周君。”鲁迅为了安慰藤野，曾故意说：“我想去学生物学，先生教给我的学问，也还是有用的。”据说后来藤野跟侄子藤野恒三郎说过：“周君是个好学生……但不是当医生的人。看来是为研究生物学才学生理学和解剖学的。”恒三郎说，听藤野先生的口气，他是相信了鲁迅分别时为安慰他而说的想学生物学的话。

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