科学家研究表示，灵长类动物在进化时出现了分支，除了向人类方向进化以外，还有一些为了适应海洋生活，逐渐演变成海猿，而由于与类人相似，所以人们常误认它们是“鱼”。
理论
据英国《每日邮报》报道，美国动物星球频道（Animal Planet）2012年公布的研究理论认为，海洋中可能确实存在类似“鱼”的生物，它们的真身是古猿在进化成为人类的过程中出现的一个分支——“海猿”。
根据这一理论，在古猿进化成早期人类的过程中，有一部分古猿进入了水中生活，成为“海猿”，它们可能在进化过程中逐渐消失并被人类遗忘了，却以“鱼”的神话形式在人类记忆中流传下来。
动物星球频道的查理福利（Charlie Foley）说：“这是一个关于人类进化史的非常激进的理论，但是我们正在接近这个古老谜团的真相。这促使我们思考，鱼可能不仅仅是神话中的生物。”

证据
尽管“海猿”理论经常被视为伪科学，但诸多证据显示早期人类的确生活在海洋附近，而且他们在非常早的时候就具备了惊人的航海能力。在希腊主陆与附近海岛上都发现了10万年前穴居人使用的工具，证明他们那时候已经能够乘船旅行。
福利还说：“人类与其它灵长类有着显著的不同，但却有许多与海洋哺乳动物相似的特征，比如手指之间的蹼状结构以及皮下脂肪等。此外，我们还有游泳、控制呼吸的本能。人类最长可屏住呼吸20分钟，远比其它陆地生物更长。”
人类应该都有游泳的本能，就算不会游泳的人，在水中也会想到自救方法，而憋气是更好的证据，陆地动物很少有可以憋气的。
历史
在日本，推古天皇27年（西元619年），在近滋贺县的蒲生川被渔夫捕获，江户时代也发生过，尤其是宽政十二年（西元1800年），在大阪西堀附近河川钓起的人鱼，多数人看过后造成轰动。这个人鱼，身高一米多，发出婴儿似的哭声。从这件事来考虑，人鱼也是传说中的幻兽，可算是相当神秘的鱼族，当时称为鲮鱼或发鱼。就这点而言，日本人的人鱼和西洋传说中的人鱼妖精，无论在形状上和性质上都迥然不同。其姿态，不见得很美形，不如说是奇形怪状较多。出现于若狭湾、九州、四国近海，专挑暴风雨迫近时于海边现形。
13世纪的《古今着闻集》里头，写道“头部像猿猴，有着像鱼一样细细的牙齿”怎么看都觉得像是怪兽。前面提到过的《诸国里人谈》记载着“有着人类的头，胸前有着如鸡冠一样红色的肉褶，下半身是鱼的形状。《古今奇谈莠句册》另有“头部有像人脸一般，眉毛眼睛俱全，皮肤很白，头发是红色的，红鳍之间有手，并且指间有蹼，下半身为鱼形”这样详尽而惊人的记载。
此外，在江户时代末期，西洋的人鱼像输入日本，研究荷兰的学者大槻玄泽所写的《六物新志》（1786年）附了人鱼的图片，上半人是人类的模样，长得如美丽的妇人之姿，下半身是鱼的形状，覆有鳞片和鱼尾，人鱼在一般人心目中的形象终于在此确立，这本书中也记载了人鱼骨，可以入药是贵重的珍品。还有传出有人发现人鱼木乃伊，足见当时的人们已经相信人鱼是实存的动物。
到了明治时期，身兼植物学与民俗学者的南方熊楠，将“儒艮”以及“海牛”等海洋动物的生态陆续写成了专著发表，因此普遍认为人鱼就是从这些海洋动物为基模幻想出来的动物，但是冲绳地方的人们依然相信人鱼真的存在，也有人不敢捕捉“儒艮”，以食用“儒艮”的肉为禁忌，因为他们崇拜人鱼，若食用人鱼的肉，恐会招来噩运。

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