棕色大熊猫是一种较为罕见的大熊猫变种个体。截至 2019 年，自有科学记录以来，世界上只发现了 6 只棕色大熊猫，它们都位于陕西秦岭腹地，这里是大熊猫的重要栖息地之一。至于棕色熊猫出现的原因，科学家们对此现象有以下推测：
第一种认为，棕色大熊猫的出现可能是由于秦岭土壤和水源中影响毛发色素合成的微量元素含量异常，从而影响其毛发中黑色素的合成。但如果是这个原因，似乎在该地区生产的大熊猫种群中应该存在从黑色到棕色的各种毛色的中间类型，但目前还没有发现这样的中间类型；
第二种是棕色体毛是基因突变造成的，但自然界中基因突变影响毛色的概率很低；

第三种认为棕色毛色是一种原始特征，即返祖学说；
四是它是一个隐性基因纯合的结果，假设体毛的颜色是由一对基因控制的，那么控制棕色体毛的基因就是隐性的。只有当父母双方同时携带这种基因时，他们的后代才能成为隐性基因的纯合子，从而长出棕色的体毛。尽管第四种解释似乎比较令人满意，但由于人类的相关信息非常少，因此还需要进一步的研究来解开棕色大熊猫的谜团。
1986年4月，在大熊猫丹丹领导时期，她与佛坪自然保护区饲养的雄性动物“弯弯”通过人工授精冷冻受孕并繁殖，于当年9月13日产下。后代出生，但没有一个存活下来。 1989年4月，丹丹再次上台，再次与万万繁殖，受孕后于当年8月31日产下幼崽，经过悉心照料，幸运地活了下来，但生长发育较为缓慢，取名“秦秦”。然而，丹丹的后代都是黑白相间的，没有一点褐色。
据居住在秦岭山区的一位老猎人说，早在1954年，他就曾在野外看到过一只毛色与丹丹相同的大熊猫。此外，其他人还在野外看到过一只棕色大熊猫的成年和幼崽。因此，很可能秦岭山区一直存在着两​​种不同毛色的大熊猫，但棕色大熊猫并不是一个独立的种群。棕色体毛被科学家认为是许多动物原始特征的表现，所以在秦岭发现的棕白色大熊猫很可能是它的一种返祖现象。
2015年8月，科学家认为棕色和白色大熊猫有遗传基础，可能是双隐性基因的结果，它是基因或稀释因子基因的组合。该中心的科学家认为，有必要继续研究棕白色大熊猫的外貌秘密。秦岭大熊猫数量少且封闭，数量估计在200到300只之间。有专家认为，大熊猫的棕色皮毛可能与当地独特的地理气候条件，以及当地的水土条件有关。来源会影响熊猫的皮毛颜色。

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