硼是人体和动植物（特别是豆类、蔬菜、水果）必须的生长元素，主要以硼酸、硼砂及其与钠、镁、钙形成的络合物三种形式存在。硼砂的化学成分是四硼酸钠，在酸性条件下以硼酸的形式存在。微量的硼对人体是有益的，如防止骨质疏松，促进钙在人体内的代谢等。
食用硼砂后，该物质会在胃酸作用转变为硼酸，由胃肠道吸收。尽管每次摄入量不多，但排出的速度很慢，从而积少成多，最终会在体内蓄积而中毒。
硼砂对人体多种器官都有毒害，危害消化道酶的作用，使食欲减退，抑制吸收各种营养素，从而加快分解脂肪，体重减轻，急性还会出现呕吐、腹泻、头晕、头痛等症状，甚至出现红斑、循环系统障碍、休克、昏迷等硼酸症。
成人中毒的剂量为1～3g，15～20g为致死量；儿童误食5g即可致死，婴儿误食2～3g可致死。100mg/d为慢性硼中毒的小剂量。
目前市面上流行的自制水晶泥的主要材料就有硼砂，这对小孩的伤害是巨大的。食品科学专家提示，硼砂毒性较高，世界各国多禁用为食品添加物，人体若摄入过多的硼砂，会引发多脏器的蓄积性中毒，小孩在做手工过程中，如果遇到皮肤破损或者不经意间用手摸到口腔黏膜，硼砂就会被人体吸收。
硼砂在人体内吸收较快，但从体内代谢出去的过程较慢。当人体摄入一定量的硼砂，就会引起消化道相关疾病，比如食欲减退、影响营养素的吸收等。
此外，硼砂具有增加食物韧性、脆度及改善食物保水性及保鲜防腐等能，一些不法商贩在制作腐竹、豆腐、米粽、米粉、面条、牛（鱼）肉丸和各种糕点等食品中添加硼砂，使产品煮不糊，韧性好，防腐，增加弹性、脆度和膨胀度。
在食品中加入少量的硼砂是过去人们传统行为，例如包粽子和炸油条时会下一点硼砂，做出来的粽子和油条好吃。在面条、腐竹中加入能提高其韧劲；在猪肉上洒硼砂可起到防腐保鲜作用等。我国《食品卫生法》和《食品添加剂卫生管理办法》中明令禁止硼砂作为食品添加剂使用。
它已经被证明是一种致癌物质，所以不存在超标不超标的问题，而是完全不许吃的问题。过去是因为不知道其危害，知道了危害还在食品中添加硼砂，严重地损害了消费者的健康权益。因此，硼砂决不能作为食品添加剂使用。
硼砂中毒后，症状较轻主要表现和食物中毒基本相似，如呕吐和腹泻；当症状严重时，会休克甚至死亡。有实验表明，人体在摄入1g硼砂后即可中毒，致死量也仅仅是15g。
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